Flora
Com uma área verde superior a 60 hectares, integrando a Reserva Ecológica Nacional, a Montanha da Penha apresenta habitats de elevado valor.
Reconhecido como um verdadeiro pulmão verde, e já tendo sido registadas 321 espécies de plantas inseridas numa região com abundancia de água, a vegetação desenvolve-se com facilidade. Apresenta áreas essencialmente ocupadas por sistemas florestais de Carvalhais e Castanheiros.
Fauna
Do ponto de vista faunístico, a Montanha da Penha apresenta um valor extremamente relevante, registando mais de 30% do total de espécies presentes em Portugal, quando se consideram os grupos faunísticos. São mais de uma centena de vertebrados terrestres, dos quais cerca de três dezenas apresentam algum tipo de estatuto de conservação em Portugal.